Ementas de Disciplinas oferecidas pela Pós-Graduação em Biofísica

BFB 701 - PRÊMIO NOBEL: LIÇÕES SOBRE IMUNOLOGIA

Professores Responsáveis: Julio Scharfstein
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Tendo como referência a biografia dos imunologistas laureados com Prêmio Nobel nos últimos 100 anos, os professores vinculados ao programa de PG descreverão o contexto em que se produziram estas extraordinárias, colocando em perspectiva sua relevância para o avanço do conhecimento sobre a função do sistema imunitário. Bibliografia: http://noelprize.org/

BFB 702 - BIOESTATÍSTICA I

Professores Responsáveis: Gilberto Weissmuller
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Introdução. Dados biológicos. Levantamento de dados e técnicas de amostragem. Estatística descritiva. Noções de probabilidade.  Distribuição normal. Estatística inferencial. Teste do Qui-quadrado (x2). Distribuição do t-Student. Análises de Variância: conceituação básica. Testes não paramétricos. Análise de regressão e correlação.

BFB 704 - INFORMAÇÃO CIENTÍFICA

Professores Responsáveis: Coordenador Científico do IBCCF
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: Conferências sobre diferentes tópicos de Biofísica e assuntos correlatos.

BFB 705 - BIOLOGIA MOLECULAR I

Professores Responsáveis: Turan Peter Urmenyi
Colaboradores: Docentes de Programa
Carga Horária: 60

Ementa: DNA; recombinação gênica; RNA; biossíntese de proteínas; regulação da expressão gênica em bactérias; o cromossomo eucariótico; organização gênica; regulação da expressão gênica em eucariotos e modelos e mecanismos de enovelamento proteico e transporte de proteínas na célula modulados por chaperoninas.

BFB 706 - ECOTOXICOLOGIA AQUÁTICA

Professores Responsáveis: Valéria Freitas de Magalhães
Colaboradores: Sandra Maria Feliciano de Oliveira e Azevedo
Carga Horária: 30

Ementa: Introdução a toxicologia: Definições poluentes e contaminantes e inter-relações dos contaminantes entre os diversos compartimentos do meio ambiente. Origem da contaminação ambiental. Destino dos contaminantes nos ecossistemas aquáticos e nos organismos. Tipos de produtos tóxicos: Xenobióticos e toxinas (com ênfase as cianotoxinas). Interação de poluentes ou biotoxinas com a biota: bioconcentração, biacumulação, biomagnificação, biotransformação, biodegradação, detoxificação e eliminação. Organismos como indicadores de qualidade ambiental: bioindicadores, biomoniotores e biom]arcadores. Classificação dos efeitos tóxicos. Vias de entrada de produtos tóxicos. Biomonitoramento. Testes de toxicidade com organismos aquáticos. Introdução a avaliação de risco ecológico e para populações humanas.

BFB 707 - EVOLUÇÃO DO SISTEMA IMUNITÁRIO

Professores Responsáveis: André Macedo Vale
Colaboradores: Juliana Echevarria Neves de Lima
Carga Horária: 30

Ementa: Evidências indicam a presença de um sistema imune rudimentar em organismos invertebrados. Tais achados sugerem que o sistema imune de mamíferos tenha evoluído a partir de ancestrais. Elementos da imunidade inata presentes em organismos primitivos persistem nos vertebrados e estão envolvidos na evolução da imunidade adaptativa. Assim, a disciplina tem como objetivo estudar a origem e evolução do sistema imune em mamíferos através da comparação dos componentes da resposta imune inata e adaptativa encontrados em invertebrados e vertebrados.

BFB 708 - PESQUISA DE DISSERTAÇÃO (M)

Professores Responsáveis: Orientador(a)
Colaboradores:
Carga Horária: 0

Ementa: Estágio no laboratório para a realização da parte experimental da dissertação de mestrado.

BFB 709 - DIDÁTICA EM BIOFÍSICA E FISIOLOGIA I

Professores Responsáveis: Coordenador do Curso de Graduação
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: Determinação de objetivos educacionais, desenvolvimento de performance mínima aceitável, estratégia educacional, planejamento curricular, tática educacional. Métodos e técnicas de instrução, construção de testes de avaliação, interpretação de resultados de testes de avaliação, planejamento de pesquisas educacionais. (Treinamento para aulas. Tutoria). Para alunos de Mestrado.

BFB 710 - VIROLOGIA SEM MISTÉRIOS

Professores Responsáveis: Clarissa Rosa de Almeida Damaso
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Aspectos moleculares da replicação dos vírus. Sistemas enzimáticos envolvidos na replicação. Síntese de macromoléculas em células infectadas. Substâncias anti-virais.

BFB 711 - BASES MOLECULARES DA PROGRESSÃO TUMORAL

Professores Responsáveis: Bruno Lourenço Diaz
Colaboradores: Todos os docentes do programa
Carga Horária: 60

Ementa: O curso abordará aspectos envolvidos no desenvolvimento tumoral incluindo as capacidades adquiridas pela célula tumoral como: auto-suficiência de fatores de crescimento: potencial ilimitado de replicação; resistência à apoptose; insensibilidade à sinais de parada do crescimento: invasividade; potencial metastático aumentado; indução da formação de novos vasos; e alterações no metabolismo celular. Também serão apresentados os avanços recentes nos estudos de oncogenes; genes supressores de tumor; transição epitélio-mesenquimal; imunologia tumoral e micro-ambiente tumoral. Os alunos deverão apresentar seminários sobre os temas do curso e participar como tutores de alunos de graduação estudando os mesmos assuntos.

BFB 712 - MEDIADORES LIPIDICOS EM INFLAMAÇÃO E CÂNCER

Professores Responsáveis: Bruno Lourenço Diaz, Christianne Bandeira de Melo
Colaboradores: Todos os docentes do programa
Carga Horária: 60

Ementa: O curso abordará os aspectos da produção e ação de medidores lipídicos com ênfase nos derivados de ácido araquidônico, em processos de base inflamatória como: câncer; alergia; aterosclerose; e infecções. Os alunos deverão apresentar seminário sobre os mais recentes avanços dos estudos de mediadores lipídicos e as potenciais implicações para seus próprios projetos de tese. OS assuntos abordados incluem: Fosfolipases A2; Lipoxigenases, ciclooxigenases; outras enzimas metabolizadoras do ácido araquidônico; sítios intracelulares de metabolização do ácido araquidônico; PAF; síntese, metabolismo, receptores, vias de sinalização; ligantes de receptores nucleares, lipoxinas; receptores, vias de sinalização e função; leucotrienos; receptores, vias de sinalização e função; prostanóides, receptores, vias de sinalização e função; patogênese da resposta inata; patogênese da asma; patogênese da aterosclerose; patogênese do câncer.

BFB 713 - SINALIZAÇÃO NA RESPOSTA AO DANO DE DNA

Professores Responsáveis: Francisco Meirelles Bastos de Oliveira
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: A disciplina tem por objetivo oferecer uma perspectiva histórica sobre a pesquisa desenvolvida na área de sinalização de dano ao DNA, com enfoque nas principais doenças/síndromes associadas à instabilidade genômica. A disciplina consiste em aulas expositivas sobre os mecanismos de  sinalização de dano de DNA, seguidas por apresentações e discussões de artigos históricos referentes ao tema.

BFB 714 - NEUROBIOLOGIA CELULAR, MOLECULAR E DO DESENVOLVIMENTO

Professores Responsáveis: Rosália Mendez Otero
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Organização celular do sistema nervoso e relação com função. Aspectos moleculares do desenvolvimento neural. Expressão gênica em neurônios e glia. Aspectos moleculares das interações neurônio-glia. Migração neural e crescimento axonal. Papel da matriz extracelular no sistema nervoso central e periférico. Estabelecimento de conexões.

BFB 715 - PROPRIEDADE INTELECTUAL

Professores Responsáveis: Eleonora Kurtenbach
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Esse curso é destinado a alunos de pós-graduação que pesquisam no campo da biotecnologia/nanotecnologia e que desenvolvem projeto de pesquisa com potencial de gerar produtos/processos patenteáveis.  O objetivo central é de motivar o aluno a proteger o conhecimento gerado na universidade quando esse apresentar aplicação industrial.  Para tanto esse curso é composto por aulas práticas online, onde o aluno é orientado a realizar uma busca de anterioridade sobre um tema do seu interesse e avaliar se o objeto a ser protegido atende aos requisitos e condições de patenteabilidade. Em seguida o aluno é motivado a redigir o seu próprio pedido de patente e a optar pela via de depósito a ser seguida. Paralelamente, aulas teóricas especialmente preparadas para esse público alvo, transmitem noções básicas sobre a propriedade intelectual/industrial.

BFB 716 - BIOÉTICA, BIOSSEGURANÇA E BOAS PRÁTICAS COM ANIMAIS EM EXPERIMENTAÇÃO

Professores Responsáveis: Marcelo Marcos Morales
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: 

Bioética: Histórico das diretrizes de ética internacional e nacional. Conceitos gerais de ética, ética em pesquisa com uso de animais.

Biossegurança: Conceitos, histórico e situação da biossegurança no Brasil. Classes de risco dos organismos biológicos; níveis de biossegurança. Equipamentos de proteção individual e coletivo. Boas práticas de laboratório. Risco químico. Risco radioativo. Padrão de procedimentos operacionais. Mapa de risco. Desinfecção e esterilização. Plano de gerenciamento de descarte de resíducos. Plano de emergência de medidas de contigência. Prevenção de incêndio.

BFB 717 - FUNDAMENTOS BIOQUÍMICOS SOBRE A TRANSIÇÃO EPITÉLIO-MESENQUIMAL NO DESENVOLVIMENTO EMBRIONÁRIO E EM DOENÇAS

Professores Responsáveis: Christina Maeda Takiya, José Osvaldo Previato, Leonardo Freire de Lima, Lucia Mendonça Previato
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: A transição epitélio-mesenquimal (TEM) é um fenômeno natural que ocorre durante a organogênese e morfogênese. Entretanto, a reativação das vias moleculares associadas à TEM também estão relacionadas a processos patológicos como a fibrose e a progressão do câncer (Fig. 1). Alterações no padrão de indução da TEM incluem o comprometimento da aderência célula-célula devido à redução da expressão da Ecaderina, associado ao aumento da expressão dos marcadores mesenquimais (N-caderina, vimentina, citoqueratinas e fibronectinas). Esse processo também pode ser caracterizado pela produção de metaloproteínases enzimas zinco dependentes capazes de degradar todos os componentes da matriz extracelular. A TEM é o ápice de uma série de eventos bioquímicos que levam a mudanças celulares, reversíveis ou não, em resposta a estímulos extracelulares. Hoje, o número de trabalhos relacionados a esse tema tem crescido exponencialmente, e o estudo dos mecanismos moleculares que governam a ativação e/ou a reativação desse processo vem contribuindo para a identificação de enzimas e suas vias metabólicas, que poderão atuar como alvos moleculares promissores no combate a diferentes doenças. Esta disciplina tem como principais objetivos: (i) discutir a participação da TEM no desenvolvimento embrionário e na doença; (ii) abordar os mecanismos moleculares associados a esse processo (iii) e entender como distúrbios metabólicos podem modular a reativação das vias moleculares associadas a TEM em condições patológicas. No decorrer do curso, os alunos terão que apresentar um seminário sobre pelo menos um tema discutido durante o curso, e redigir uma mini-revisão, conceituando de maneira objetiva os tópicos abordados nos seminários apresentados.

BFB 718 - DIDÁTICA EM BIOFÍSICA E FISIOLOGIA II

Professores Responsáveis: Coordenador do Curso de Graduação
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Determinação de objetivos educacionais, desenvolvimento de performance mínima aceitável, estratégia educacional, planejamento curricular, tática educacional. Métodos e  técnicas de instrução, construção e testes de avaliação, interpretação de resultados de testes de avaliação, planejamento de pesquisas educacionais. (aulas de graduação). Para alunos de Doutorado.

BFB 719 - TRÁFEGO INTRACELULAR DE VESÍCULAS

Professores Responsáveis: Narcisa Leal da Cunha e Silva
Colaboradores: Maria Cristina Machado Motta
Carga Horária: 45

Ementa: Aulas teóricas e discussão de trabalhos abordando. O complexo de Golgi; exocitose constitutiva e exocitose regulada; a via endocítica; revestimentos vesiculares; o citoesqueleto e tráfego vesicular; identidade dos compartimentos intracelulares; fusão de membrana; reconstituição in vitro do tráfego vesicular.

BFB 720 - FUNDAMENTOS EM MICROSCOPIA CONFOCAL: DA TEORIA À PRÁTICA

Professores Responsáveis: Marcelo Felippe Santiago
Colaboradores: Victor Túlio Ribeiro de Resende
Carga Horária: 45

Ementa: O microscópio confocal: Componentes e funcionalidade do “hardware” (laser, fibra óptica, “framegraber”, fotodetectores, fotomultiplicadores e outros componentes). Aspectos ópticos e mecânicos. Princípio da microscopia de varredura por laser. Caminho óptico, espelhos dicróicos (HFT e NFT) e filtros (LP e BP). Resolução ó´ptica e digital. Preparação de amostras: corantes fluorescentes utilizados em microscopia confocal e meios de montagem. Aquisição de imagens: “single track”, “multitrack” ou “lambda mode”. Geração de imagens em 2D, 3D ou 4D (imagens convencionais, em pilhas ou videomicroscopia). Preparação e apresentação de imagens em 3D: galeria, projeção, animação rotatória, imagens estereográficas, projeção “color-coded height”, secções ortogonais e secções obliquas. Utilização do microscópio confocal como ferramenta: FRET, FRAP e FLIP.

BFB 721 - ACADEMIC WRITING FOR AN INTERNATIONAL SCIENCE

Professores Responsáveis: Edson Rondinelli
Colaboradores: Rosane Silva
Carga Horária: 30

Lecture 1: Introduction. Story telling and Story content;
Lecture 2: Story structure; Writing for the public; IMRAD; Tables and Figures; Results and Methods;
Lecture 3: Introduction; Discussion; Abstract; Title; Key words; Plagiarism and Paraphrasing;
Lecture 4 : Story language I;
Lecture 5: Story language II;
Lecture 6: Condensing; Grammar tips; Revising first draft; Final version;  Submission and Peer review;
Lecture 7: Posters: preparing, revising and presenting a Poster.

BFB 722 - INTRODUÇÃO A RESSONÂNCIA MAGNÉTICA NUCLEAR DE IMAGEM

Professores Responsáveis: Ronaldo da Silva Mohana Borges
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Introdução à técnica de RMN aplicada à imagem, aplicações clínicas das sequências de pulso de RMN, aplicações clínicas das sequências de pulso de RMN; artefatos que influenciam a imagem de RMN; fundamentos de imagem avançada em RMN, considerações sobre bioefeito e segurança da RMN; meios de contraste em RMN.

BFB 723 - SEMINÁRIOS DO LABORATÓRIO DE BIOLOGIA MOLECULAR E BIOQUIMICA DE PROTEINAS

Professores Responsáveis: Eleonora Kurtenbach
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Serão discutidos os resultados obtidos nas teses dos alunos de pós-graduação e nos projetos de Iniciação Científica. Também serão abordados artigos recentes relacionados às quatro linhas de pesquisa do laboratório (caracterização das defensinas Psd1 e Psd2 da ervilha P. sativum, investigação das vias de sinalização e análise estrutural e funcional de proteínas desconhecidas envolvidas na resposta da levedura S. cerevistae a estresses, modelos experimentais de cardiopatia dilatada bem como publicações sobre temas atuais de grande impacto na comunidade científica internacional.

BFB 724 - BIOLOGIA DE FLAVIVÍRUS I

Professores Responsáveis: Ronaldo da Silva Mohana Borges
Colaboradores: Clarissa Rosa de Almeida Damaso; Amilcar Tanuri; Luciana de Almeida Hinds; Davis Fernandes Ferreira; Iranaia Miranda; Marcelo Torres Bozza; Marcos Sorgine.
Carga Horária: 45

Ementa: Aspectos gerais das flaviviroses; epidemiologia; estrutura viral; replicação e montagem; conceitos moleculares e estruturais das proteínas dos flavivírus; imunidade inata e infecção por flavivírus; resposta do hospedeiro durante infecção; diagnóstico; vacinas anti-flavivírus; interação vetor-vírus; vetores de flavivírus e estratégia para seu controle.

BFB 725 - MICROSCOPIA ELETRONICA DE VARREDURA

Professores Responsáveis: Marcia Attias
Colaboradores: Márcia Attias, Maria Cristina Machado Motta, Narcisa Leal da Cunha e Silva e Rossiane Claudia Vommaro e Kildare Rocha de Miranda.
Carga Horária: 30

Ementa: Princípios de funcionamento do microscópio de varredura. Formação da imagem. Processamento de amostras, fixação química, desidratação, secagem e metalização. Métodos especiais, biossegurança.

BFB 726 - ESPECTROMETRIA DE ABSORÇÃO ATÔMICA: PRINCÍPIOS E USO ECOTOXICOLÓGICO DA TÉCNICA

Professores Responsáveis: Paulo Renato Dorneles
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Histórico e fundamentos da espectrometria de absorção atômica (AAS);  as técnicas de atomização (FAAS, HGAAS, CVAAS, GFAAS); garantia de  qualidade / controle de qualidade na determinação de elementos-traço;  cuidados na coleta e armazenagem de amostras; limites de detecção;  curvas de calibração; adição de analito; soluções-branco;  interferências espectrais e não espectrais; corretores de fundo  (contínuo; Zeeman); material certificado de referência (CRM) e padrão  interno; informações ecotoxicológicas obtidas por AAS (a determinação  de elementos-traço como ferramenta auxiliar em estudos de ecologia  alimentar); o uso da AAS para avaliação da exposição de organismos a  compostos organometálicos.

BFB 727 - SEMINÁRIOS DE GLICOBIOLOGIA

Professores Responsáveis: Wagner Barbosa Dias
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: A disciplina abrange todas as sub-areas da Glicobiologia, focalizando nos trabalhos científicos recentes de alto nível. Os trabalhos geralmente são retirados das revistas Glycobiology, Journal of Biological Chemistry, Science, Nature, Biochemistry, Biochemical Journal, Cellular Microbiology, Cancer, Oncogene entre outras. Os principais temas abordados são: metabolismo de açúcares, biossintese de glicanas, interação parasita-hospedeiro, glicobiologia do câncer, O-GlcNAc, lectinas, importância do ácido siálico, caracterização estrutural de glicanas, relacionar estrutura e função biológica de glicoconjugados no sistema imune.

BFB 728 - ASPECTOS EVOLUTIVOS E MOLECULARES DE CIANOBACTÉRIAS

Professores Responsáveis: Sandra M.F. de Oliveira e Azevedo
Colaboradores: Ana Beatriz Furlanetto Pacheco, Rosane Silva e Brett Neilan (The New South Wales University – Austrália, Prof. Visitante)
Carga Horária: 30

Ementa: Aspectos evolutivos e adaptativos de cianobactérias: origem, filogenia e diversidade. Serão abordados os avanços do conhecimento em aspectos evolutivos do grupo das cianobactérias, os processos adaptativos que permitiram ao grupo colonizar diferentes habitats, a diversidade metabólica e molecular incluído a discussão sobre estudos genônimos, proteômicos e metagenômicos. Serão também abordadas as hipóteses sobre a produção de toxinas e outros metabólitos secundários, incluindo a comunicação celular intra e interespecífica.

BFB 729 - BIOLOGIA DE FLAVIVÍRUS II

Professores Responsáveis: Ronaldo da Silva Mohana Borges
Colaboradores: Clarissa Rosa de Almeida Damaso; Amilcar Tanuri; Luciana Hinds; Davis Fernandes Ferreira; Iranaia Miranda; Marcelo Torres Bozza; Marcos Sorgine
Carga Horária: 45

Ementa: Curso experimental; titulação viral; cultivo de célula e infecção por dengue; PRNT; ensaio de atividade enzimática da NS3; diagnóstico sorológico; diagnóstico molecular por PCR em tempo real.

BFB 730 - MODIFICAÇÃO PÓS-TRADUCIONAL

Professores Responsáveis: Wagner Barbosa Dias
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Modificação pós-traducional (MPT) é qualquer modificação química que ocorre na proteína após sua tradução. Apesar do projeto genoma humano ter revelado a presença de apenas 25.000 genes, estudos atuais acreditam que o número de diferentes proteínas encontradas no nosso organismo passe facilmente de 1.000.000 em virtude das MPTs. Em adição, já se sabe que essas MPTs governam o tráfego, degradação, atividade e função molecular. Essa disciplina abrange as principais modificações pós-traducionais, focalizando principalmente nos diferentes tipos de glicosilação, fosforilação, ubiquitinação, âncora GPI e proteólise. Os alunos terão que apresentar um seminário mostrando a importância da MOT abordada no estudo e entregar um estudo dirigido conceituando brevemente a MPT escolhida.

BFB 731 - IMUNOLOGIA FUNDAMENTAL

Professores Responsáveis: Ana Carolina Oliveira, Leonardo Holanda Travassos Correa
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Fisiologia do sistema imune: ontogenia de células e órgãos do sistema linfóide, diferenciação linfocitária, tráfico linfocitário, moléculas de adesão. Bases moleculares do sistema imunológico: teoria de seleção cl onal, estrutura de imunoglobulinas, bases molecular da especificidade de ligação; base genética da diversidade de imunoglobulinas, complementaridade idiotípio (network), estrutura e genética dos TCR's, MHC: estrutura, organização gênica, polimorfismo genético, base estrutural do reconhecimento dos antígenos de classe I/II; mecanismos de processamento antigênico. Ativação e função linfocitária: interleucinas, principais marcadores fenotípicos de linfócitos, funções associadas com os marcadores CD4+ (Th1/Th2), CD8+ NK, regulação de receptores para citoquinas, ativação linfócitária, apoptosis. Imunidade celular: ativação de sistema microbicidas em macrófagos; mecanismo de defesa contra infecção intracelular; sistemas de citotoxicidade celular. Tolerância imunológica: mecanismo de deleção clonal, tolerância periférica e anergia, apoptosis, mecanismos alternativos de supressão, network, etc. Mecanismo imunológicos em processos patológicos. Autoimunidade: doenças autoimunes; modelos experimentais; perspectivas de intervenção terapêutica. Alergia e inflamação: reações de hipersensibilidade, IgG, mediadores, complemento. Mecanismos imunológicos de defesa à doenças infecciosas e vacinação, Influenza (vírus), tuberculose/lepra (mycobacteria). Imunologia do cãncer e imunoterapia.

BFB 733 - SEMINÁRIOS EM NEUROBIOLOGIA

Professores Responsáveis: Coordenador do P.A.Neurociências
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Organização morfo-funcional do sistema visual. Neurobiologia e psicofísica visual, depressão alastrante, desenvolvimento e plasticidade do sistema nervoso.

BFB 735 - TOPICOS AVANÇADOS EM DESENVOLVIMENTO E TUMORAL DO SNC

Professores Responsáveis: Rodrigo Alves Portela Martins
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Conceitos fundamentais de eventos fisiológicos do desenvolvimento e fisiopatológicos da tumorigênese do sistema nervoso central serão abordados através da apresentação por parte dos alunos de estudos clássicos e publicações recentes de grande relevância nessa área de conhecimento.

BFB 737 - INTRODUÇÃO À NEUROBIOLOGIA DO DESENVOLVIMENTO

Professores Responsáveis: Leny Alves Cavalcante
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Eventos iniciais na formação do sistema nervoso dos vertebrados. Comunicação intercelular na neuroectoderma. Neurulação I, Neurulação II. Proliferação celular e expressão fenotípica no reuroepitélio. A crista neural. Migração neuronal no sistema nervoso periférico e central. Crescimento do axônio. Dendritogênese e sinaptogênese. Interação neurônio-glia em diversos períodos ontogênicos.

BFB 740 - CITOTOXICIDADE MEDIADA POR CÉLULAS

Professores Responsáveis: Pedro Muanis Persechini, Vivian Mary Barral Dodd Rumjanek
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Parte teórica: caracterização de diversas sub-populações de células citolíticas com especial atenção aos linfócitos T e às células "Natural Killer"; mecanismos de reconhecimento e ligação alvo-efetor; moléculas envolvidas na citotoxicidade celular e seu mecanismo de ação; morte celular programada e apoptose; tópicos avançados em citotoxicidade e revisão da literatura recente. Parte prática: ensaios de citotoxicidade.

BFB 741 - RADIO E FOTOBIOLOGIA

Professores Responsáveis: Alvaro Augusto Costa Leitão
Colaboradores: Claudia de Alencar Santos Lage
Carga Horária: 90

Ementa: Interação das radiações com a matéria. Origem das lesões induzidas pelas radiações e pelos agentes químicos. Radioquímica e fotoquímica de ácidos nucléicos. Medidas da inativação em diferentes níveis de organização biológica. Fatores que modificam a sensibilidade às radiações ionizantes. Mecanismos celulares de reparação. Efeitos somáticos das radiações ionizantes e não ionizantes.

BFB 743 - FÍSICO-QUÍMICA I

Professores Responsáveis: Paulo Mascarello Bisch
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Leis da termodinâmica: energia e entropia. Potenciais termodinâmicos: energia livre. Teoria cinética dos gases. Soluções diluídas: potenciais químicos e eletroquímicos. Reações químicas: equilíbrio químico. Equilíbrio Associação-Dissociação: pH. Equilíbrio eletroquímico: potenciais de membranas, Interações hidrofóbicas-hidrofílicas: agregados moleculares. Processos de transporte: difusão, viscosidade. Transporte através de membranas.

BFB 744 - TÓPICOS EM NEUROBIOLOGIA DA RETINA

Professores Responsáveis: Fernando Garcia de Mello, Patricia Franca Gardino, Rafael Linden, Ricardo Augusto de Melo Reis
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Seminários com os trabalhos que estão sendo desenvolvidos nos laboratórios de Neurogênese, Neurobiologia da Retina e Neuroquímica e trabalhos da literatura.

BFB 745 - TÉCNICAS DE ESPALHAMENTO DE LUZ

Professores Responsáveis: Susana Frases Carvajal
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Aulas teóricas e discussão de trabalhos abordando: conceitos teóricos sobre os princípios do espalhamento de luz. Bases teóricas das técnicas de espalhamento de luz dinâmico e estático. Conceitos teóricos do potencial Zeta. Preparação de amostras. Aplicações das técnicas de espalhamento de luz na Nanotecnologia, Biologia e Biomedicina. Lipossomos: Estudos de caracterização e estabilidade. Caracterização de anticorpos: Estudos de interações Antígeno-Anticorpo. Caracterização de nanocristais de celulose formados a partir de papel reciclado. Aplicação na indústria cosmética e farmacêutica. Caracterização de ouro coloidal. Caracterização de moléculas de DNA. Caracterização de proteínas: Determinação de pontos isoelétricos, predição das constantes de equilíbrio.Caracterização de polímeros. Caracterização dos polissacarídeos capsulares de Cryptococcus neoformans e C. gattii.

BFB 746 - BASES BIOQUÍMICAS DA NEUROTRANSMISSÃO SINÁPTICA

Professores Responsáveis: Fernando Garcia de Mello
Colaboradores: Ricardo Augusto de Melo Reis
Carga Horária: 120

Ementa: Síntese e degradação de GABA no SNC. Descarboxilase do ácido glutâmico (GAD). Receptores Gabaérgicos; localização do sistema Gaba no SNC; liberação sináptica; efeito de drogas; implicações fisiológicas e patológicas dependentes de Gaba. Técnicas para estudo do sistema Gabaérgico. Síntese e degradação de catecolaminas; enzimas envolvidas no metabolismo de catecolaminas; receptores dopaminérgicos, participação do AMPc na modulação dopaminérgica; localização do sistema dopaminérgico no SNC; liberação sináptica, efeito de drogas; implicações fisiológicas e patológicas dependente de dopamina. Técnicas para o estudo do sistema dopaminérgico. Síntese e degradação da acetilcolina; receptores nicotínicos e muscarínicos; localização do sistema colinérgico no SNC; liberação sináptica. Aminoácidos excitatórios e neurotoxicidade; papel em disfunções do SNC. Modelos de estudo: retina de aves, cultura de células e de  tecido nervoso. 

BFB 747 - MICROSCOPIA ELETRÔNICA DE TRANSMISSÃO

Professores Responsáveis: Kildare Rocha de Miranda
Colaboradores: Marcia Attias, Maria Christina Machado Motta, Narcisa Leal da Cunha e Silva, Rossiane Claudia Vommaro.
Carga Horária: 60

Ementa: Princípios de funcionamento do microscópio eletrônico de transmissão. Processamento de amostras; fixadores, tampões, desidratação, emblocamento, ultramicrotomia, contrastação positiva. Citoquímica de enzimas, citoquímicas de carbioidratos. Imunocitoquímica, reconstrução 3D, tomografia, criotécnicas.

BFB 749 - SEMINÁRIOS EM IMUNOBIOFÍSICA

Professores Responsáveis: Pedro Muanis Persechini
Colaboradores: Julieta Schachter
Carga Horária: 30

Ementa: O curso consiste de reuniões semanais com duração de 60 a 90 min onde são apresentados e discutidos artigos atuais em imunologia e imunobiofísica e experimentos em andamento. Cada reunião é conduzida, em sistema de rodízio, por um dos alunos inscritos. Eventualmente contamos com a participação de conferencistas convidados. Os temas principais são: receptores de nucleotídeos (P2), mecanismos de citotoxicidade, canais iônicos e transdução de sinal em células do sistema imune, especialmente macrófagos e linfócitos citotóxicos.

BFB 751 - MICROSCOPIA OPTICA

Professores Responsáveis: Marcos Farina de Souza
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: 

Teórica: difração, figura de Airy, resolução, formação da imagem, olho, lupa, microscópio, iluminação de Kohler, objetivas, oculares, condensadores, fontes luminosas, filtros, fotografia em microscopia óptica, contraste de fase, polarização e contraste interferência e fluorescência.

Prática: uso correto de microscópio, Kohler, diafragmas de campo e de abertura, imersão, fotomicrografia,  micrometria, fluoromicroscopia e polarização. Video microscopia e processamento de imagens.

 

BFB 753 - SEMINÁRIOS DE NEUROGÊNESE

Professores Responsáveis: Rafael Linden
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Tópicos de desenvolvimento do sistema nervoso, aspectos celulares e moleculares, em particular regulação de populações neuronais, interações tróficas, fatores neurotróficos, fenômenos regressivos, apoptose. O curso será baseado em seminários duas vezes por semana (terças e quintas), ao meio-dia, apresentados em sistema de rodízio pelos alunos inscritos e demais participantes.

BFB 761 - DEZ LIVROS PARA LER ANTES DO PhD

Professores Responsáveis: Mauro de Freitas Rebelo
Colaboradores: João Paulo Machado Torres e Milton Osório Moraes
Carga Horária: 60

Ementa: História e filosofia da ciência, método científico. Biografias de pesquisadores famosos.

BFB 762 - PENSE E DANCE: A FILOSOFIA DO DESENHO EXPERIMENTAL

Professores Responsáveis: Mauro de Freitas Rebelo
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Lógica dedutiva e indutiva, método científico, hipótese nula, medidas de tendência central e dispersão, probabilidade e testes de hipótese, conceitos de resolução e número amostral, criatividade, desenho experimental.

BFB 765 - ÉTICA E INTEGRIDADE NA PESQUISA CIENTIFICA E TECNOLÓGICA

Professores Responsáveis: Adalberto Ramon Vieyra, Martha Meriwether Sorenson, Sonia Vasconcelos
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: A moral e a ética. Ética em ciência & Tecnologia. Integridade em Pesquisa. A má conduta na ciência. A fabricação, a falsificação e o plágio (FFP). Práticas questionáveis em pesquisa. “The Singapore Statement”. Ética em publicações científicas. O plágio científico e a paráfrase. Práticas lingüísticas questionáveis na comunicação científica. “Retractions” na ciência. Autoria intelectual e responsabilidade autoral.

BFB 767 - FILOSOFIA E HISTÓRIA DA CIÊNCIA

Professores Responsáveis: Maria Cristina Machado Motta
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: Neste curso, nós empregaremos a perspectiva metodológica defendida pelos Science Studies, “Estudos Sociais de Ciência e Tecnologia”.  O que é história da ciência? (as relações da história da ciência com a história); O que é filosofia da ciência? (as relações da filosofia da ciência com a filosofia); A pergunta: “o que é a ciência?”; O que são os Science Studies? Por que investigar a ciência a partir das perspectivas da filosofia e da história? (Augusto, Fernando & Cristina). Uma breve história da filosofia da ciência (I): a profissionalização do cientista no século XIX – os dilemas da profissionalização da atividade de pesquisa; a produção filosófica dos cientistas; um estudo de caso: os físicos na passagem do século XIX para o século XX. (Augusto, Leonardo & Cristina). Uma breve história da filosofia da ciência (II) - A filosofia da ciência no século XX: o exemplo de Kuhn no quinquagésimo aniversário da publicação da Estrutura das Revoluções Científicas (André & Cristina). Science studies, prática científica, controvérsias científicas: o início da física moderna no Brasil (Augusto,  André & Cristina). A questão do ethos na ciência - dois exemplos: Ciência pós-acadêmica e o sistema biomédico de investigação (Verusca & Cristina). Objetividade e verdade: virtudes epistêmicas ou critérios epistemológicos? (Fernando, Augusto, Cristina & Priscila). Ciência, Técnica e Metafísica – Heidegger, Heisenberg, Discussão geral (Fernando, Juliana, Cristina & Augusto)

BFB 768 - SEMINÁRIOS DE PROTOZOOLOGIA

Professores Responsáveis: Rossiane Claudia Vommaro, Técia Maria Ulisses de Carvalho, Wanderley de Souza
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos publicados ou em realização na área. Conferências a serem ministradas por pesquisadores de outras instituições que atuam na área de Protozoologia.

BFB 769 - IMUNOLOGIA

Professores Responsáveis: Bruno Lourenço Diaz, Robson Coutinho Silva
Colaboradores: Todos os docentes do programa
Carga Horária: 90

Ementa: Fisiologia do sistema imune. Bases moleculares do sistema imunológico. Ativação e função linfocitária. Imunidade celular. Tolerância imunológica. Mecanismos imunológicos em processos patológicos. Autoimunidade. Alergia e inflamação. Mecanismos imunológicos de defesa à doenças infecciosas e vacinação, influenza (vírus), tuberculose/lepra (mycobacteria). Imunologia do câncer e imunoterapia.

 

BFB 771 - NEUROTRANSMISSORES E PLASTICIDADE SINÁPTICA

Professores Responsáveis: Ricardo Augusto de Melo Reis
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Introdução ao Curso: Neurônio e glia, SNP e SNC; Estrutura e Função SN; Sinalização Elétrica e Química; Propriedades e Características das Sinapses; Receptores Neurotransmissores; Respostas Comportamentais – dos canais iônicos às populações neuronais; Desenvolvimento do SNC: Papel de Neurotransmissores na Gênese, Proliferação e Migração Neuronal; Alterações biológicas e desordens; Fatores Tróficos e Apoptose, Transdução de Sinal. Sinalização e Respostas gênicas Plasticidade Neuronal:Módulos Cerebrais: localização e função; Períodos Críticos – O que nos faz humanos, Linguagem, Ritmos Biológicos e Genes; Neurotransmissores e Patologias Cerebrais Sinapse Colinérgica: Receptores Muscarínicos e Nicotínicos; Sinapse Neuromuscular como modelo; Terminal Pré- e Pós-Sináptico; Animais transgênicos e Knock-outs Sinapse Glutamatérgica Excitabilidade; despolarização, Receptores e Sinalização, Animais knockout e transgênicos; Memória e Aprendizagem, LTP e LTD, Excitotoxicidade Neuronal.; Alzheimer, Esclerose, Isquemia Sinapse Gabaérgica Inibição e Depressão; Receptores e Sinalização Gabaérgica, Animais knockout e transgênicos; Alcoolismo, Ansiedade e Epilepsia Sinapse Serotoninérgica, modulações Comportamentais, Receptores e Sinalização, Diversidade de Respostas Ansiedade e Depressão, Alucinação; Ações hipotalâmicas e mesencefálicas no controle da fome (Obesidade) e do Sexo (Compulsão) Sinapse Catecolaminérgica, Vias dopaminérgicas, noradrenérgicas e Adrenérgicas: receptores e sinalização. Dependência de drogas e a cocaína, Sistemas de motivação e recompensa, Parkinson e os gânglios da base Sinapses Peptidérgicas: tipos e Propriedades; Alças regulatórias Neurotransmissores não convencionais: Gases, metais e lipídeos. Outras Sinapses: gases,  metais e lipídeos como neurotransmissores e  neuromoduladores. Sistema Límbico e o cérebro emocional, Amigdala, Hipocampo, Hipotálamo e o SNA, Memória explícita e implícita, Emoção, Cognição e Comportamento, Psicologia evolutiva, Plasticidade Cerebral, Considerações Finais.

BFB 772 - MECANISMO DE PROCESSAMENTO ANTIGÊNICO

Professores Responsáveis: Julio Scharfstein
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Através de discussões de artigos científicos originais, pretende-se reconstruir o percurso interdisciplinar (imunologia, bioquímica e biologia celular) que conduziu ao conhecimento sobre mecanismos de processamento e apresentação antigênica. Na primeira parte, pretende-se revisar conhecimentos sobre os tópicos de bioquímica e biologia celular pertinentes ao assunto (biogênese de lisosomas e de outros compartimentos da via secretória, glicosilação e outras modificações pós-traducionais de proteínas, natureza e função de chaperoninas, proteinases lisosomais e citosólicas). Neste amplo contexto, pretende-se focalizar o debate sobre aspectos diretamente relacionados com apresentação antigênica, à saber: descrição das vias de apresentação, relações estrutura-função das moléculas MHC, influência sobre a geração de repertório, controle genético da resposta imune, implicações para estratégias de vacinação e em fenômenos de auto-imunidade.

BFB 773 - TÓPICOS EM NEURODEGENERAÇAO

Professores Responsáveis: Rafael Linden
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Ciclo celular e degeneração; morte celular programada no sistema nervoso e outros sistemas biológicos; formas de degeneração celular; apoptose e necrose; mecanismos de degeneração celular; segundos mensageiros envolvidos em degeneração celular; genes e proteínas "killer" e protetoras; fatores neurotróficos; neurotoxicidade; biologia celular e molecular de doenças neurodegenerativas.

BFB 774 - SEMINÁRIOS EM BIOFÍSICA AMBIENTAL

Professores Responsáveis: João Paulo Machado Torres
Colaboradores: Olaf Malm & Jean Remy Davée Guimarães.
Carga Horária: 30

Ementa: Caracterização de fontes; processos de amostragem; físico-química ambiental de metais pesados e substâncias orgânicas; métodos de medida; cadeias tróficas. Toxicologia ambiental; traçadores radioativos.

BFB 775 - SEMINÁRIOS EM RADIO E FOTOBIOLOGIA

Professores Responsáveis: Alvaro Augusto Costa Leitão
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Efeitos biológicos das radiações ionizantes e não ionizantes em todos os níveis de organização biológica. Processos de reparação em células procarióticas e eucarióticas.  Mutagênese e genotoxicidade; detecção e caracterização dos mecanismos moleculares dos agentes genotóxicos.  Interação das radiações entre si e com outros agentes físicos e químicos. Radioterapia e fototerapia. Patologias relacionadas a deficiência em sistemas de reparação.

BFB 776 - ABORDAGENS HISTOLOGICAS DA RETINA

Professores Responsáveis: Patricia Franca Gardino
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Trata-se de um curso eminentemente prático, mas que também aborda aspectos teóricos da metodologia usada rotineiramente no laboratório de Neurobiologia da Retina.  O aluno pode usar em seu modelo de tese estas técnicas para visualizar marcadores celulares (glia/neurônio), enzimas de síntese para neurotransmissores, receptores de membrana, proteínas de citoesqueleto, entre outros.  Estudará através da histoquímica enzimática o estado de ativação de enzimas; e algumas colorações de rotina para o tecido retiniano.   Cada aluno trará seu problema metodológico para tentar ser respondido por algumas destas técnicas.

BFB 777 - CINTILAÇÃO LÍQUIDA, ESPECTROSCOPIA GAMA E PROTEÇÃO RADIOLÓGICA

Professores Responsáveis: Jean Remy Davée Guimarães
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Fundamentos teóricos, meios cintiladores, detetores, extinção, análise de espectros simples e compostos, identificação e quantificação de isótopos em mistura, tratamento de dados e apresentação de resultados. Estatística de contagens. Princípios básicos de Proteção Radiológica na manipulação de isótopos radioativos.

BFB 778 - AVALIAÇÃO DA CONTAMINAÇÃO AMBIENTAL E HUMANA POR METAIS PESADOS

Professores Responsáveis: Olaf Malm
Colaboradores: Jean Remy Davée Guimarães e João Paulo Machado Torres
Carga Horária: 30

Ementa: Ciclo Geral de Metais; Metais Pesados, toxicidade; Emissões naturais e antropogênicas: Origem e quantificação relativa. Usos Industriais. Formas dos metais no meio ambiente. Lançamentos e transformações. Metais dissolvidos ou associados a partículas. O que é disponível biologicamente? Incorporação biológica. Acumulação e biomagnificação. Transformações nos organismos. Homem. Tempo de residência. Efeitos tóxicos. Monitoração. Utilização de traçadores radioativos e isótopos estáveis em ciências ambientais, possibilidades e limitações. Estudos de casos. Rio Paraíba do Sul - Rio Guandu: Cádmio no Rio Paraibuna. Amazônia; Minamata; Toyama. Seminários. Teste de percepção de risco de câncer para diferentes agentes tóxicos.

BFB 779 - SISTEMAS SENSORIAIS DE VERTEBRADOS E INVERTEBRADOS

Professores Responsáveis: Silvana Allodi
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Estrutura macroscópica, microscópica e subcelular dos sistemas somestésico, visual, auditório, gustatório e olfatório, tanto de vertebrados como de invertebrados. Também se estudam aspectos fisiológicos destes sistemas. Metodologia: aulas teóricas expositivas ministradas pela professora e seminários apresentados pelos alunos.

BFB 782 - SEMINÁRIOS EM BIOLOGIA E BIOQUÍMICA DE INSETOS

Professores Responsáveis: Ednildo de Alcântara Machado
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Aspectos da fisiologia dos insetos, principalmente associados ao sistema reprodutivo e digestivo, tais como: Aspectos comportamentais da cópula e oviposição de insetos; glândulas acessórias do sistema reprodutivo e suas secreções durante a oviposição; hormônios e transdução de sinal no controle da formação de ovos nos insetos; interação vírus-receptor em trato digestivo e reprodutivo de insetos; receptores de hormônios e proteínas de vitelo no trato reprodutivo de insetos; diversos aspectos da interação parasito-vetor no trato digestivo de insetos.

BFB 784 - BIOLOGIA DE PROTOZOÁRIOS

Professores Responsáveis: Rossiane Claudia Vommaro
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Aulas teóricas, práticas e seminários sobre os seguintes protozoários: Trypanosoma cruzi, Leishmania, Trypanosoma brucei, Toxoplasma gondii, Plasmodium, Trichomonas vaginalis, Giardia lamblia, Entamoeba histolytica. Aspectos biológicos, interação com a célula hospedeira e mecanismos de escape.

BFB 786 - TÓPICOS ESPECIAIS EM BIOFÍSICA I

Professores Responsáveis: Coordenação de PG
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica 

BFB 787 - TÓPICOS ESPECIAIS EM BIOFÍSICA II

Professores Responsáveis: Coordenação de PG
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BFB 788 - SEMINÁRIOS DE IMUNOLOGIA

Professores Responsáveis: Todos os docentes do Programa
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Os seminários constam de apresentação de artigos, resultados experimentais dos trabalhos em andamento no laboratório, e conferências eventuais de pesquisadores convidados. Todos os participantes fazem apresentações periódicas de artigos. Os temas abordados são de natureza diversa, mas especial atenção é dada a: temas gerais de imunologia; temas gerais de biofísica molecular e celular; canais iônicos no sistema imune; citotoxicidade mediada por linfócitos (abordagem molecular e celular); macrófagos; AIDS e imunoparasitologia.

BFB 789 - SEMINÁRIOS DE BIOLOGIA CELULAR

Professores Responsáveis: Marcia Attias, Maria Cristina Machado Motta, Narcisa Leal da Cunha e Silva, Sonia Rozental, Wanderley de Souza
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos publicados e em andamento na área de Biologia Celular, enfatizando resultados inovadores e novas abordagens metodológicas.

 

BFB 790 - INTRODUÇÃO A RESSONÂNCIA MAGNÉTICA NUCLEAR MULTIDISCIPLINAR DE MACROMOLÉCULAS

Professores Responsáveis: Ronaldo da Silva Mohana Borges
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Princípios básicos clássicos de ressonância magnética nuclear (RMN); descrição teórica de RMN; sistemas multi-spins; RMN uni, bi e multidimensional; relação e processos dinâmicos; aspectos experimentais de RMN; experimentos de RMN heteronucleares; assinalamento sequencial e cálculo de estruturas de macromoléculas (proteínas, DNA e carbohidratos).

BFB 793 - IMUNOBIOFÍSICA

Professores Responsáveis: Pedro Muanis Persechini
Colaboradores: Julieta Schachter
Carga Horária: 60

Ementa: Parte teórica: conceitos básicos de imunologia celular; conceitos básicos de canais iônicos, receptores e transdução de sinal; canais iônicos de linfócitos, fagócitos mononucleares e outros leucócitos; o papel fisiológico destes canais; transporte e controle das concentrações iônicas e de pH em leucócitos; proteínas formadoras de poro no sistema imune; receptores de nucleotídeos (P2) e seu papel no sistema imune. Tópicos avançados em imunobiofísica e revisão da literatura recente. Parte prática: detecção de correntes iônicas em células do sistema imunológico.

BFB 794 - O NASCIMENTO DO PENSAMENTO OCIDENTAL

Professores Responsáveis: Maria Cristina Machado Motta
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: O Espanto como princípio da filosofia. As questões de criança e as grandes áreas da filosofia. Linha cronológica dos principais pensadores; 2) Hesíodo, A Teogonia e as primeiras cosmologias míticas. 3) O mundo Mítico: Homero, Ilíada. O Herói, a Honra e a cultura da Vergonha. Arete, excelência, Hybris, desmedida. Os deuses humanos e os homens divinos; 4) O mundo Mítico: Homero, Odisséia. O nostos (retorno) do Herói, o mundo dos mortos, a alma e a questão do sujeito da Grécia arcaica; 5) Os primeiros filósofos, chamados pré-socráticos: Tales, Anaxímenes, Anaximandro (os jônicos), Leucipo e Demócrito (os atomistas). Os elementos, “Tudo é um”, Substância e a interpretação de Aristóteles; 6) Os Eleatas: Pitágoras e os números. Parmênides e o radicalismo do monismo eleata. Zenão e Melisso. Heráclito e o mobilismo. 7) Sócrates, os sofistas e a arte do bem falar da Ágora: Górgias e Protágoras. 8) Platão e os diálogos. Os diálogos iniciais e as aporias. Os diálogos da maturidade, a República e as três imagens centrais: o sol, a linha dividida e a caverna. 9) Aristóteles e a metafísica da Substância (ousia). As quatro causas, Ato e potência. 

BFB 796 - BIOFÍSICA ESPECIAL I

Professores Responsáveis: Coordenador do Curso de Graduação
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BFB 797 - BIOFÍSICA ESPECIAL II

Professores Responsáveis: Coordenador do Curso de Graduação
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BFB 798 - BIOFÍSICA ESPECIAL III

Professores Responsáveis: Coordenador do Curso de Graduação
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BFB 799 - SEMINÁRIOS EM TERAPIAS CELULARES

Professores Responsáveis: Rosália Mendez Otero
Colaboradores: Marcelo Marcos Morales
Carga Horária: 30

Ementa: Biologia das células tronco: aspectos gerais, aspectos éticos e legais. Diferentes tipos de células tronco: embrionárias, germinativas, fetais, adultas. Células tronco hematopoiéticos e mesenqumais. Características morfo-funcionais dos diferentes tipos de células tronco. Isolamento, cultivo e características fenotípicas dos diferentes tipos de células tronco. Células tronco no indivíduo adulto. Estudos em modelos animais de terapias celulares. Localização do “homing” das células tronco através da marcação com radiofármaco. Estudos clínicos. Protocolos em andamento e em discussão.

BFB 801 - TOPICOS AVANÇADOS EM DINÂMICA MOLECULAR

Professores Responsáveis: Pedro Geraldo Pascutti
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Tópicos em Mecânica e Dinâmica Molecular, uso de termostatos e barostatos, tratamentos eletrostáticos pelos métodos Soma de Ewald e Campo de Reação. Métodos de paralelização e uso de GPU (unidade de processamento gráfico) em simulações de proteínas e biomembranas. Parametrização de fármacos empregando métodos de Mecânica Quântica. Protocolos de simulação. Desenvolvimento de scripts para tratamento de dados em linguagens Shell, Awk e TCL. Análise de resultados: cálculo de desvios e flutuações conformacionais, estabilidade de estruturas secundárias e ligações hidrogênio, análise de componentes principais de movimentos, oscilações de em larga escala, análises gráficas, elaboração de animações. Introdução aos métodos híbridos QM/MM (Mecânica quântica/mecânica molecular). “Steered molecular dynamics” e “coarse grained”. Introdução ao cálculo de energia livre.

BFB 805 - CULTURA DE TECIDOS ANIMAIS E BIOLOGIA TECIDUAL

Professores Responsáveis: Antonio Carlos Campos de Carvalho, Regina Coeli dos Santos Goldenberg
Colaboradores: Adriana Bastos Carvalho, Fernando Costa e Silva Filho, Rosália Mendez Otero e Marcelo Felippe Santiago
Carga Horária: 90

Ementa: História e objetivos da bioengenharia tecidual. As bases do crescimento e diferenciação celulares. Desenvolvimento tecidual in vitro. Células-tronco. Transplante de células e tecidos. Biomateriais na engenharia tecidual. Técnicas de microscopia avançada.

BFB 806 - PUBLICAÇÃO DE ARTIGO CIENTÍFICO I

Professores Responsáveis: Orientador(a)
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Publicação de artigo científico completo em revista indexada com índice de impacto igual ou superior a qualis A no qual o aluno seja primeiro autor.

BFB 808 - PESQUISA DE TESE (D)

Professores Responsáveis: Orientador(a)
Colaboradores:
Carga Horária: 0

Ementa: Estágio no laboratório para a realização da parte experimental da Tese de Doutorado.

BFB 809 - ESCOLA DE ALTOS ESTUDOS EM BIOPROTISTAS

Professores Responsáveis: Narcisa Leal da Cunha e Silva
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Teoria e aplicação de diversas técnicas e métodos de Microscopia Óptica e Eletrônica aplicados ao estudo da Biologia Celular de Protistas: Microscopia Óptica: Princípios básicos. Microscopia óptica: Contraste de Fase e Contraste Interferencial. Microscopia de Fluorescência. Microscopia confocal e multi-fotônica. Microscopia Óptica de alta resolução. Microscopia de Força Atômica. Introdução à Microscopia Eletrônica de Transmissão. Introdução à Microscopia Eletrônica de Varredura. Criomicroscopia. Reconstrução Tridimensional. Citoquímica e Imunocitoquímica. Microanálise. Confocal Microscopy for Cellular Microbiology Studies of Bacterial Toxins. urvival and Death in the Third Dimension. Improved Sensitivity by using a Spectral GaAsP Array Detector for Fluorescence Detection in Confocal Imaging at the Zeiss LSM 780. Long and Short Distance Protein Sharing in the Immune System. Second Harmonic Microscopy. Species-Selective Nanoscale Imaging in fixed and living cells. SIM, dSTORM and PAL-M: Three Ways to Outsmart Diffraction Limits. Four-Dimensional Cryo Electron Microscopy at Atomic Resolution. Cryo-EM Studies of Nascent Polypeptide Chains on the Ribosome.  Characterization of an Essential Motile Process of Toxoplasma for Cell Invasion : Conoid Extrusion. Imaging the endo-lysosomal system by ‘correlative live cell - electron microscopy' (CLEM) and ‘section light electron microscopy' (SLEM). The use of High Pressure Freezing in Correlative Light Electron Microscopy. Event Streamed Spectrum Imaging in Biological Electron Probe X-ray Microanalysis. Imaging Trace Metals in Life and Disease with X-Ray Fluorescence Microscopy. Advances in Biological Microanalysis Using EFTEM and EELS. Structural bases of force transmission during directed cell migration. TEM Tomography for Thick Biological Specimens. 3 Dimensional Microscopy, Large Volume Serial Block Face Imaging in the SEM. Template matching as a tool to analyze electron tomograms. Towards Visualization of Nanomachines in their Native Cellular Environment. Electron Microscopy and Spectroscopy in Four Dimensions. Far-Field Optical Nanoscopy. Growth and Aging of Nanomorphologies. 

BFB 810 - MÉTODOS DE FÍSICA MOLECULAR E ESPECTROSCOPIA

Professores Responsáveis: Paulo Mascarello Bisch, Pedro Geraldo Pascutti
Colaboradores:
Carga Horária: 120

Ementa: 

1. Mecânica Quântica: fundamentos da física moderna; funções de onda, interpretação de Born e princípio da incerteza; partícula em uma caixa uni-dimensional: espectro discreto; movimentos vibracionais e rotacionais.
2. Estrutura Atômica e Molecular: o átomo de hidrogênio: espectros, funções de distribuição radial; átomos multieletrônicos; teoria de ligação de valência; teoria do orbital molecular.
3. Propriedades Elétricas e Magnéticas da Matéria: isolantes, condutores e semicondutores; dipolos elétricos e interações intermoleculares; propriedades magnéticas.
4. Espectroscopia: espectroscopia Raman; fluorescência e fosforescência; lasers e aplicações; ressonância magnética.

BFB 811 - EXPRESSÃO GÊNICA E METAGENÔMICA

Professores Responsáveis: Débora Souza Faffe, Rosane Silva, Turan Peter Urmenyi
Colaboradores:
Carga Horária: 120

Ementa: 

(a) Genômica e Metagenômica. Padrões globais de expressão gênica: Transcriptômica e Proteômica. Aplicações de Bioinformática: Manipulação computacional de seqüências gênicas, análise filogenética. 
(b) Mecanismos de regulação gênica. Estudo de sequências reguladoras por ensaio de transfecção com gene repórter. Ensaios quantitativos de expressão de mRNAs especifícos por RT-PCR em tempo real

BFB 812 - FUNDAMENTOS DE BIOLOGIA CELULAR

Professores Responsáveis: Marcia Attias, Narcisa Leal da Cunha e Silva
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Membranas biológicas: estrutura e composição; fluidez de membranas; transporte através de membranas; receptores; sinalização celular; junções intercelulares; matriz extracelular; citoesqueleto; mitocondria; cloroplasto; peroxisomo; hidrogenosomo; retículo endoplasmático; complexo Golgi; e endocitose.

BFB 813 - FUNDAMENTOS BIOFÍSICOS NO ESTUDO DE MACROMOLÉCULAS

Professores Responsáveis: Jennifer Lowe
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Métodos biofísicos de estudo das soluções (osmometria, pHmetro, diálise, espectrofotometria e fluorimetria). Métodos biofísicos no estudo de macromoléculas: precipitação “salting-out”, “salting-in”, ultracentrifugação, eletroforese, isoeletrofocalização e eletroforese bidimensional, cromatografia de camada fina, cromatografia em coluna, métodos de detecção de macromoléculas.

BFB 814 - NEUROBIOLOGIA DA GLIA

Professores Responsáveis: Silvana Allodi
Colaboradores: Leny Alves Cavalcante
Carga Horária: 45

Ementa: As células da glia, que já foram consideradas meros coadjuvantes dos neurônios, estão cada vez mais atraindo a atenção de neurocientistas, o que tem gerado crescente produção de importantes informações a seu respeito. Para entender melhor seu papel, no curso serão estudados tópicos como: a morfologia dos diversos tipos de células da glia de vertebrados, seu desenvolvimento, a fisiologia geral destas células e suas interações com os neurônios. Para compreensão das origens evolutivas da glia, serão estudadas também aspectos diversos das células da glia de invertebrados. Finalmente, serão abordados o papel da glia no funcionamento do sistema nervoso e alguns aspectos patológicos do sistema nervoso que envolvem estas células.  

BFB 816 - PUBLICAÇÃO DE ARTIGO CIENTIFICO II

Professores Responsáveis: Orientador(a)
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Publicação de artigo científico completo em revista indexada com índice de impacto igual ou superior a qualis A no qual o aluno seja primeiro autor.

BFB 817 - CÉLULAS GLIAIS

Professores Responsáveis: Leny Alves Cavalcante
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: 

1. Biologia básica da macroglia (incluindo células ependimárias) e microglia;
2. Biologia básica de células tipo radial (Mueller, Bergmann, tanicitos);
3. Biologia básica da glia embainhante olfatória e células de Schwann;
4. Glia e barreira hemato-encefálica;
5. Glia e modulação do meio extra-celular;
6. Glia na depressão alastrante e na anoxia;
7. Papel da glia na injúria e na regeneração neural;
8. Glia como parte do sistema imune;
9. Interações glio-parasitárias;
10. Glia em doenças degenerativas. Glioma.

BFB 818 - IMUNOLOGIA DAS MUCOSAS

Professores Responsáveis: Bartira Rossi Bergmann
Colaboradores: Herbert Leonel de Matos Guedes & Daniel Claudio de Oliveira Gomes
Carga Horária: 30

Ementa: Anatomia das mucosas e sistemas linfóides associados. Integração do sistema imune de mucosas, IgA secretória e outras moléculas efetoras. Captação e apresentação de antígenos. Migração de linfócitos T. Tolerância x imunidade ativa. Infecções e vacinas.

BFB 819 - SEMINÁRIOS DE IMUNOPROTOZOOLOGIA

Professores Responsáveis: Bartira Rossi Bergmann
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de publicações atuais nas áreas de: citocinas, diferenciação linfocitária, métodos imunológicos, tolerância; imunologia de leishmaniose e amebíase.; produtos naturais e sintéticos em doenças parasitárias. Discussão de resultados relativos ao projeto desenvolvido.

BFB 820 - TÓPICOS AVANÇADOS EM BIOLOGIA ESTRUTURAL I

Professores Responsáveis: Ronaldo da Silva Mohana Borges
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos publicados ou em realização na área. Conferências a serem ministradas por pesquisadores de outras instituições que atuam na área de Biologia Estrutural.

BFB 821 - SEMINÁRIOS DE MICOLOGIA

Professores Responsáveis: Sonia Rozental
Colaboradores: Celuta Sales Alviano
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação de artigos, resultados experimentais dos trabalhos em andamento no laboratório e conferências eventuais de pesquisadores convidados. Todos os participantes fazem apresentações periódicas de artigos. Os temas abordados são de natureza diversas mas especial atenção é dada a: Temas gerais de micologia; Caracterização de estruturas de superfície em fungos; Mecanismos de ação de drogas fungicidas e fungestáticas; Interação fungo-células hospedeiras. Imunoparasitologia.

BFB 822 - SEMINÁRIOS DO PROGRAMA DE BIOLOGIA MOLECULAR

Professores Responsáveis: Docentes do Programa de Biologia Molecular
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos publicados ou em realização na área. Conferências a serem ministradas por pesquisadores de outras instituições que atuam na área de Biologia Molecular.

BFB 823 - LEITURA CRÍTICA E REDAÇÃO CIENTÍFICA

Professores Responsáveis: Marcela de Freitas Lopes
Colaboradores: Flávia Gomes (Professor Visitante do IBCCF)
Carga Horária: 30

Ementa: Análise de estrutura e conteúdo de artigos científicos de imunologia. Dicas de como escrever um artigo científico. Bases teóricas para a publicação científica (qualidade científica), bases para redação do texto científico. Após uma exposição de aproximadamente uma hora dos assuntos de interesse pela professora, será discutido um artigo científico com foco na forma e no conteúdo. Os alunos apresentarão os artigos e suas observações sobre forma e conteúdo, os outros alunos terão lido o artigo e discutirão com o docente.

BFB 824 - BIOLOGIA DE FUNGOS

Professores Responsáveis: Sonia Rozental
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Aulas teóricas, palestras e seminários sobre aspectos básicos da biologia de fungos, abordando os seguintes temas: taxonomia, dimorfismo, componentes de superfície celular, ultraestrutura, ação de antifúngicos, interação com a célula hospedeira e mecanismos de escape.

BFB 825 - BIOLOGIA CELULAR DA APOPTOSE E DA INFLAMAÇÃO

Professores Responsáveis: Célio Geraldo Freire de Lima
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: O curso abordará aspectos avançados sobre a resposta inflamatória e sua regulação pelo envolvimento de células apoptóticas. Serão abordados especialmente, os pontos relacionados à ativação de fatores de transcrição, interação celular, receptores envolvidos no reconhecimento e captura de células apoptóticas, produção de mediadores químicos com ações pró e anti-inflamatórias (citocinas e eiosanoides) e regulação da resposta imune inata e adaptativa. Objetiva-se que, ao término do curso, os alunos sejam capazes de formar conhecimento a cerca dos mecanismos envolvidos na resposta inflamatória, incluindo principalmente, a participação de produtos provenientes  desta resposta. O curso abordará aulas expositivas e discussão de artigos científicos. A avaliação será feita pela apresentação de seminários pelos alunos. É centrado na apresentação e discussão de artigos científicos que descrevem um tópico atual e relevante nas áreas de inflamação e/ou apoptose. O assunto a ser discutido pode variar cada vez que o curso é oferecido, objetivando assim, a apresentação de novos conceitos e/ou novos fenômenos na área.

BFB 826 - ESCOLA DE ALTOS ESTUDOS EM PROTISTAS II

Professores Responsáveis: Marcia Attias, Wanderley de Souza
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Introdução geral ao estudo dos protistas. Respostas mecanoquímicas de amebídeos à Matriz Extracelular. Organização estrutural de Apicomplexa. O ciclo evolutivo do Toxoplasma gondii. Interação Apicomplexa-Célula Hospedeira. Proteômica. Introdução à Ordem Kinetoplastida. Ultra-estrutura de Tripanosomatídeos. Genômica. Biologia dos Tricomonadídeos.  Biologia de Giardia lamblia.

BFB 827 - LINFOCITOS T E SEU HOSPEDEIRO

Professores Responsáveis: George Alexandre dos Reis, Marcela de Freitas Lopes
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Curso centrado na apresentação e discussão de artigos recentes sobre um tema escolhido, atual, em imunorregulação por linfócitos T. Um novo tema é apresentado cada vez que o curso é oferecido, visando atualizar os alunos numa área de fronteira.  

BFB 828 - MICROPOLUENTES ORGÂNICOS

Professores Responsáveis: João Paulo Machado Torres
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Dinâmica de poluentes orgânicos no meio ambiente. Organoclorados, PCBs, dioxinas e furanos, retardantes de fogo, compostos fluorinados. Hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs). Conceitos de lipofilicidade (Kow), Modelos de Fugacidade. Dinâmica de contaminantes na cadeia trófica. Dispersão global de poluentes. Destilação global. Efeito gafanhoto. Uso de pesticidas no mundo. A questão dos agrotóxicos no país.

BFB 830 - CITOCINAS E NEUROIMUNOMODULAÇÃO

Professores Responsáveis: Alfred Sholl Franco
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Noções gerais de Neuroimunomodulação focalizando na relação existente entre a neuropoese, hematopoese e o papel das citocinas nestes processos. Barreira hemato-encefálica e células imunocompetentes no sistema nervoso central. Citocinas: histórico, nomenclatura, sistemas de classificação e a caracterização estrutural e funcional das famílias de citocinas. Classes de receptores para citocinas: vias de sinalização ativadas e papéis funcionais. Citocinas e o desenvolvimento do sistema nervoso. Inflamação e regulação imune no sistema nervoso. Ação de citocinas durante lesões do sistema nervoso e processos neurodegenerativos. Citocinas e autoimunidade: EAE e MS: erros e acertos. Terapias baseadas em citocinas no sistema nervoso.

BFB 831 - NEUROEDUCAÇÃO

Professores Responsáveis: Alfred Sholl Franco
Colaboradores: Lucianne Fragel Madeira, Camila Marra, Talita da Silva de Assis, Gustavo Henrique Varela Saturnino Alves, Tatiana Maia Barreto, Anna Carolina Miguel.
Carga Horária: 60

Ementa: Esta disciplina visa promover a interação entre os campos das neurociências e da educação e o desenvolvimento de atividades teórico-práticas voltadas para a relação ensino-aprendizagem nos diferentes níveis acadêmicos (básico e superior). Serão abordados os seguintes temas: filosofia do conhecimento, desenvolvimento do sistema nervoso, períodos críticos, corporeidade, sensações, movimento, funções superiores (atenção, motivação, percepção, aprendizado, memória, cognição, linguagem e inteligências), distúrbios da aprendizagem e comportamento, sono e aproveitamento acadêmico.

BFB 833 - SEMINÁRIOS CIANO-ECOTOX

Professores Responsáveis: Valéria Freitas de Magalhães
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: A disciplina abrange todas as sub-áreas da Biofísica Ambiental com ênfase em Ecofisiologia e Toxicologia de cianobactérias, focalizando nos trabalhos científicos recentes de alto nível. Os trabalhos geralmente são retirados das revistas Aquatic Toxicology toxicon, chemosphere, ecotoxicology and environmental safety, Journal of Toxicology and Environmental Health, Environmental Toxicology Pollution, Environmental Toxicology and Chemistry, Environmental Microbiology. Applied Environmental Microbiology, Harmful Algae, entre outras. Os principais temas abordados são: ecotoxicologia de ´gua, biologia molecular no estudo de cianobactérias.

BFB 834 - SEMINÁRIOS DE IMUNOPARASITOLOGIA

Professores Responsáveis: Cerli Rocha Gattass
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Tópicos básicos de imunologia; tópicos de imunoparasitologia; interação parasito-hospedeiro; resposta imune celular e humoral; papel de citocinas nas infecções parasitárias; aspectos clínicos e patológicos da infecção por parasitas; vacinação.

BFB 835 - INTRODUÇÃO À MICROSCOPIA DE FORÇA ATÔMICA

Professores Responsáveis: Gilberto Weissmuller
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Princípios físicos envolvidos nas diversas microscopias. Princípios físicos envolvidos na microscopia de força atômica. Progressos alcançados nos últimos anos. Funcionamento dos componentes do microscópio. Eletrônica de detecção de sinal. Scanner. Software de controle. Acoplamento de microscópio ótica ao AFM. Modos de scanning. Error mode. Contact mode. Tapping mode. Análise de imagens. Imagens digitais. Brilho e contraste. Análise de fourier. Filtros. Medidas de força. Espectroscopia de força. Medidas de viscoelasticidade. Force-mapping.

BFB 836 - MODELAGEM E DINÂMICA DE BIOMOLÉCULAS

Professores Responsáveis: Paulo Mascarello Bisch, Pedro Geraldo Pascutti
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Introdução à Estrutura e dinâmica de macromoléculas biológicas. Aspectos estruturais de proteínas. Ácidos nucléicos e açucares. Confromação de proteínas. Restrições inerentes ã cadeia polipeptídica. Estruturas secundárias: hélices-a, folhas-b e estruturas terciária. Pontes de hidrogênio, hidrofobicidade, cargas e efeitos de solvente. Funções potenciais para interações intra e inter-moleculares. Bases teóricas. Forma de funções potenciais. Potenciais harmônicos optencial torcional. Interação de Van der Waals. Interação eletrostática. Métiodos para otimização de gemotria. Minimização de energia. Algoritmo steepest descents. Algoritmo dos gradientes conjugados. Métodos para simulação de dinâmica. Equações de movimento para sistemas atômicos. Algoritmo de Verlet. Algoritmo Leapfrog. Simulação explícita do solvente. Condições periódicas de contorno. Condições de contorno estocásticas. Dinâmica de proteínas. Movimentos em curta escala de tempo. Dinâmica atômica e de cadeias laterais. Movimentos em larga escala de tempo. Transições estruturais locais. Mudanças estruturais globais. Análise de modos normais de vibração. Influência do solvente. Dinâmica da associação molecular. Métodos termodinâmicos e estatísticos. Cálculo da variação  da energia livre. Teoria da perturbação termodinâmica. Método de Monte Carlo. Generalized Simulated Annealing.

BFB 837 - PROJETO DE TESE (D)

Professores Responsáveis: Orientador(a)
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: Apresentação perante uma Banca Examinadora do Projeto de Tese de Doutorado. O aluno deverá obter média 7.0 para aprovação.

BFB 840 - SEMINÁRIOS DE BIOLOGIA IMUNITÁRIA

Professores Responsáveis: George Alexandre dos Reis, Marcela de Freitas Lopes
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: O curso constará de seminários apresentados semanalmente em sistema de rodízio pelos alunos inscritos e demais participantes. Serão apresentados artigos sobre temas gerais de imunologia e assuntos relacionados a imunologia de doenças parasitárias, autoimunidade, imunopatologia, apoptose e imunorregulação.  Também serão apresentados resultados experimentais dos  trabalhos em andamento no laboratório.

BFB 841 - ESCOLA DE ALTOS ESTUDOS – GENÔMICA FUNCIONAL

Professores Responsáveis: Paulo Mascarello Bisch
Colaboradores: Leticia Lery
Carga Horária: 90

Ementa: Aplicações da Genômica Funcional (metagenômica, epigenômica, RNA-seq, CHIP-seq, filogenômica, entre outros) nos mais variados sistemas biológicos (ambiental, parasitologia, fisiologia, imunologia, virologia, etc) – todos os dias do curso, sempre pela manhã. As tardes serão ministradas aulas práticas sobre a análise computacional de dados de genômica funcional, focadas em dados provenientes de sequenciamento de “nova geração”. 

BFB 842 - COMUNICAÇÃO E DIVULGAÇÃO CIENTIFICA

Professores Responsáveis: Alfred Sholl Franco
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Nesta  disciplina serão estudadas as características da comunicação e divulgação científica (CC e DC), as técnicas e linguagens específicas utilizadas nos diferentes veículos (mídias utilizadas) de divulgação. Serão abordados mecanismos tradicionais e as novas tecnologias de comunicação e informação, assim como o uso de transmídia na CC e DC. Assim, sera fornecido um panorama geral sobre as distintas linguagens e veículos utilizados na divulgação de C & T (TV, rádio, jornais diários, revistas especializadas e não-especializadas em CC e DC, centros e museus de ciência, Internet, eventos de rua, escolas, exposições etc.), bem como os distintos atores envolvidos no processo. Serão discutidos os desafios contemporâneos da CC e DC, considerando vantagens e limitações dos distintos veículos e linguagens, assim como os processos de integração entre CC/DC, pesquisa e ensino. Serão discutidos os métodos e técnicas para coleta e avaliação de dados em DC e o uso de ambientes colaborativos. A avaliação será através da produção de trabalhos de CC e DC em diferentes formas após a definição de grupos de trabalho nos projetos de extensão envolvidos na disciplina. Com a produção e veiculação dos materiais produzidos pretende-se alcançar os objetivos da CC e DC, tais como diminuir a distância entre ciência e tecnologia e a comunidade. Alem disso, pretende-se ampliar o acesso ao conhecimento científico e tecnológico pela população, desenvolvendo e aperfeiçoando seu senso crítico diante da grande quantidade de informações surgidas diariamente. Outrossim, esta disciplina visa ampliar a formação acadêmica dos alunos participantes através da elaboração das atividades sugeridas e das discussões realizadas em espaços formais e não-formais de ensino. As aulas práticas estão relacionadas ao desenvolvimento de projetos de extensão (Ciências e Cognição - Núcleo de Divulgação Científica e Ensino de Neurociências; Construindo o Saber; Espaço Memorial; Sábados da Ciência; dentre outros) credenciados junto à pró-reitoria de extensão, os quais envolvem oficinas práticas e o desenvolvimento de produtos científicos, artísticos e educacionais nas áreas biológicas, tecnológicas e humanísticas com o objetivo de integrar curricularmente o ensino de pós-graduação e pesquisa às atividades de extensão.

BFB 843 - BIOLOGIA MOLECULAR II

Professores Responsáveis: Rosane Silva
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Seminários de discussão de artigos científicos e revisões sobre tópicos específicos de mecanismos moleculares. Os alunos deverão apresentar discutir e criticar os artigos em profundidade conceitual e metodológica. Cada aluno deverá apresentar ao final do curso um pequeno projeto de pesquisa, de sua escolha, fundamentado em problemática em aberto na literatura.

BFB 844 - SEMINÁRIOS DE ESTUDO DA EXPRESSÃO GÊNICA

Professores Responsáveis: Rosane Silva, Turan Peter Urmenyi
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de artigos científicos publicados na área. News and Views – breve apresentação em forma de notícia, de um tópico de fronteira na área, Apresentação e discussão dos resultados experimentais de alunos do laboratório.

BFB 845 - SEMINÁRIOS SOBRE ESTRUTURA E FUNÇÃO DE PROTEASES

Professores Responsáveis: Ana Paula Cabral de Araujo Lima, Julio Scharfstein
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Através de seminários (discussão de artigos científicos), pretende-se discutir a base estrutural da especificidade de substrato (e susceptibilidade à inibidores) de enzimas proteolíticas. O seminário também contempla o estudo do contexto biológico que suscita essas questões, com destaque para aspectos que implicam proteases como elementos chaves do reconhecimento celular em processos fisiológicos (por exemplo, tráfego intracelular e  mecanismos de apresentação de antígenos, mecanismos de apoptose) e  patofisiológicos (processos inflamatórios, neoplasia e metastase, mecanismos de virulência em infecções parasitárias). Completando estes tópicos, pretende-se discutir as recentes inovações biotecnológicas neste campo (por exemplo, os avanços que surgem no desenvolvimento de quimioterápicos, bem como os estudos dos mecanismos que conferem resistência contra inibidores de proteases). 

BFB 846 - BIOFÍSICA ESPECIAL I

Professores Responsáveis: Docente que Ministra a Disciplina
Colaboradores:
Carga Horária: 15

Ementa: 

BFB 847 - BIOFÍSICA ESPECIAL II

Professores Responsáveis: Docente que Ministra a Disciplina
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa:

BFB 848 - BIOFÍSICA ESPECIAL III

Professores Responsáveis: Docente que Ministra a Disciplina
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa:

BFB 850 - BIOFÍSICA ESPECIAL V

Professores Responsáveis: Docente que Ministra a Disciplina
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa:

BFB 851 - BIOFÍSICA ESPECIAL VI

Professores Responsáveis: Docente que Ministra a Disciplina
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa:

BFB 853 - ELEMENTOS BÁSICOS DE PROGRAMAÇÃO APLICADOS A MODELAGEM MOLECULAR

Professores Responsáveis: Pedro Geraldo Pascutti
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Introdução à programação. Técnicas básicas de programação. Estruturas básicas de dados. Tabelas em memória. Programação estruturada ou modular.

BFB 855 - ATPases TRANSPORTADORAS DE ÍONS

Professores Responsáveis: Adalberto Ramon Vieyra
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Transporte ativo. Transporte ativo mediado por ATPases de organelas. Transporte ativo primário de Na+ e Ca++ através da membrana plasmática. Mecanismos de transporte. Ciclos de catálise. Acoplamento entre fluxos iônicos e transdução de energia. Modificações moleculares de ATPases como marcadores de doenças. 

BFB 858 - MEMBRANA PLASMÁTICA E SISTEMAS DE SINALIZAÇÃO CELULAR

Professores Responsáveis: Marcelo Einicker Lamas
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: (A) Histórico sobre Membrana Plasmática: Composição química, funções, propriedades, os diferentes modelos propostos, a membrana plasmática como ponto de partida de vias de sinalização celular, microdomínios regulatórios (rafts). (B) Receptores de membrana: estrutura, função, classes. Será dada ênfase aos receptores acoplados a proteínas Gs e receptores com atividade tirosina cinase. Localização de receptores em microdomínios regulatórios (ativação ou desativação). (C) Moléculas sinalizadoras e segundos mensageiros: natureza (hidrofílicos e hidrofóbicos), geração de moléculas sinalizadoras, lipídeos de membrana como fontes de moléculas sinalizadoras, terminação de sinal.

BFB 859 - TEMAS ATUAIS NA IMUNIDADE INATA

Professores Responsáveis: Robson Coutinho Silva
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa:  Introdução a imunidade Inata. Moléculas da imunidade inata. Células da Imunidade inata. Sinais de Perigo ou também chamados “Padrões Moleculares Associados a Dano” (DAMP), e Inflamassomas. Receptores tipo Toll (TLR),  Receptores de reconhecimento de padrões (PPR);  Receptores  Nod –like ( NLRs) ,  e o retinoid acid inducible gene –I (RIG)-like receptors  (RLRs).

BFB 860 - RELAÇÕES GENE-AMBIENTE

Professores Responsáveis: Mauro de Freitas Rebelo
Colaboradores:
Carga Horária: 60

Ementa: Mecanismos moleculares de resposta ao estresse ambiental. Contaminação ambiental e outros tipos de estresse. Papel do pool gênico nos mecanismos de adaptação e resposta ao estresse ambiental. Principais sistemas bioquímicos e moleculares de resposta ao estresse. Técnicas de avaliação e quantificação da resposta ao estresse.

BFB 861 - OFICINA DE ESCRITA CRIATIVA EM CIÊNCIA

Professores Responsáveis: Mauro de Freitas Rebelo
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Discutir problemas de escrita como imitação, cópia, tédio, criatividade, técnica, medo, inovação, critério e preguiça. Elementos de linguagem, teoria da narrativa e mídias. Método científico e divulgação científica, e outros elementos que favoreçam os alunos na hora de produzir uma monografia, dissertação, tese ou artigo científico.

BFB 868 - EXPRESSÃO GÊNICA EM BACTÉRIAS

Professores Responsáveis: Ana Beatriz Furlanetto Pacheco
Colaboradores: Wanda M. A. von Krüger
Carga Horária: 30

Ementa: Introdução ao controle da expressão gênica em bacterias e técnicas para seu estudo; como as células bacterianas monitoram e respondem a alterações ambientais; controle da expressão gênica em diferentes níveis (transcricional, pós-transcricional, traducional, pós-traducional); a resposta estringente; controle da expressão gênica relacionado à densidade populacional (quorum sensing); a resposta SOS; controle da expressão gênica na patogênese; apresentação e discussão de artigos. 

BFB 871 - ORGANIZAÇÃO ESTRUTURAL E FUNCIONAL DE GENOMAS EM GRANDE ESCALA: PROJETOS GENOMA

Professores Responsáveis: Turan Peter Urmenyi
Colaboradores: Rosane Silva
Carga Horária: 75

Ementa: Nova área da Biologia Molecular: Genômica. Histórico. Estrutura do genoma em grande escala. Classificação funcional. Índice gênico. Metodologias. Mapeamento genético e físico. Sequenciamento em grande escala. Anotação gênica. Métodos tradicionais e shotgun. Bioinformática. Manipulação computacional de seqüências gênicas. Apresentação e análise de dados obtidos. Pós-genoma. Farmacogenômica. Padrões globais de expressão gênica. Microarrays. Proteômica. SNPs. Comparações evolutivas.

BFB 872 - ORIENTAÇÃO DE ALUNOS DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA

Professores Responsáveis: Coordenação de PG
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Determinação de objetivos educacionais, desenvolvimento de performance mínima aceitável, estratégia educacional, planejamento curricular, tática educacional. Métodos e  técnicas de instrução, construção e testes de avaliação, interpretação de resultados de testes de avaliação, planejamento de pesquisas educacionais. 

BFB 873 - ESCOLA DE ALTOS ESTUDOS: PARASITOLOGIA MOLECULAR E CELULAR

Professores Responsáveis: Ana Paula Cabral de Araujo Lima
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: 

BFB 876 - SEMINÁRIOS AVANÇADOS EM FÍSICO-QUÍMICA BIOLÓGICA

Professores Responsáveis: Adalberto Ramon Vieyra, Marcelo Einicker Lamas
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos da literatura científica abordando os seguintes tópicos. Membranas: estrutura, dinâmica e função. Processos de transporte através da membrana: cinética e mecanismos. Transporte de íons e moléculas não carregadas. Difusão simples. Difusão facilitada. Transporte ativo primário, secundário e terciário ATPases transportadoras. Regulação dos processos de transporte em sistemas biológicos. Papel de hormônios e autacóides. Sistemas e mecanismos de sinalização celular envolvidos na regulação de processos de transporte: moléculas sinalizadoras em biomembranas. Processos de transporte na função celular. ATPases em quadros patológicos.

BFB 877 - TÓPICOS AVANÇADOS EM MICROSCOPIA DE FORÇA ATÔMICA

Professores Responsáveis: Gilberto Weissmuller
Colaboradores:
Carga Horária: 75

Ementa: Microscopia: Modos de scanning. Error mode. Contact mode. tapping mode. Escolha da técnica adequada para  obtenção  de  imagens.  Técnicas de imobilização de amostras sobre um suporte sólido: modificação covalente. Análise de imagens. Espectroscopia de força: Funcionalização do tip: modificação covalente. Analise de cursas de força. Adesão. Elasticidade. Indentação. Dureza. Force mapping. Análise de curvas de força de interação receptor-ligante.3) AULAS PRÁTICAS: Técnicas de imobilização de amostras sobre um suporte sólido: modificação covalente. Funcionalização do tip: modificação covalente.

BFB 878 - PROTEASES: ESTRUTURA, REGULAÇÃO E FUNÇÃO BIOLÓGICA

Professores Responsáveis: Julio Scharfstein
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Pretende-se discutir a base estrutural da especificidade de substrato (e susceptibilidade à inibidores) de enzimas proteolíticas. Contemplar também o estudo do contexto biológico que suscita essas questões com destaque para aspectos que implicam proteases como elementos chaves do reconhecimento celular em processos fisiológicos (por exemplo, tráfego intracelular e mecanismos de apresentação de antígenos, mecanismos de apoptose) e patofisiológicos (processos inflamatórios, neoplasia e metastase, mecanismos de virulência em infecções parasitárias).

BFB 883 - CÉLULAS TRONCO

Professores Responsáveis: Antonio Carlos Campos de Carvalho, Rosália Mendez Otero
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Curso teórico baseado na apresentação e discussão de artigos recentes sobre o assunto. Eventuais demonstrações de técnicas e experimentos nos laboratórios do IBCCF.

BFB 884 - INTRODUCAO A BIOINFORMÁTICA

Professores Responsáveis: Paulo Mascarello Bisch
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Introdução sobre a utilização da Internet para pesquisas de bancos de dados genéticos. Análise de seqüências de DNA e de seqüências protéicas. Programas de busca por ohomologia (Blastin, Blastx); Alinhamento por similaridade de seqüências (Clustal) e definição de ORFs (Orfinder). Program a de buscas múltiplas por similaridade (Blastif), Programa de buscas por motivos protéicos (INterpro) e outros programas modelagem e sites de busca na internt (Embos, swiss modler,primers)

BFB 885 - FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA

Professores Responsáveis: José Osvaldo Previato, Lucia Mendonça Previato, Mauro Sola-Penna
Colaboradores:
Carga Horária: 45

Ementa: Organização celular, metabolismo celular, metabolismo de carboidratos, metabolismo de lipídeos, metabolismo de proteínas, função hormonal, biossíntese proteica, biossíntese lipidica, biossíntese de carboidratos complexos, biossintese de glicoconjugados, integração metabólica.

BFB 886 - ÂNCORAS DE GLICOSILFOSFATIDILINOSITOL (GPI)

Professores Responsáveis: Norton Heise
Colaboradores:
Carga Horária: 30

Ementa: Discussão da estrutura e biossíntese das diferentes formas de âncoras GPI, as principais metodologias empregadas na sua detecção e caracterização, e qual a sua distribuição e importância para protozoários, fungos e mamíferos. Serão abordados de maneira detalhada todos os aspectos complexos (bioquímicos e moleculares) que envolvem a sua: (i) biossíntese; (ii) espécie-especificidade; (iii)  topologia/compartimentalização; e (iv) enzimologia. Aspectos dinâmicos do transporte, direcionamento, distribuição e das funções de moléculas ancoradas via GPI serão abordados utilizando modelos celulares de mamíferos, fungos, e de protozoários como T. brucei e Leishmania sp. Finalmente, serão também abordadas algumas das patologias em que proteínas ancoradas via GPI estão envolvidas. As atividades serão divididas entre aulas expositivas e apresentação de seminários acompanhados de discussão. A avaliação será feita através do desempenho do aluno na apresentação dos seminários e na avaliação escrita.

BFB 887 - DESENVOLVIMENTO DE CIRCUITOS NEURAIS

Professores Responsáveis: Cecilia Hedin Pereira
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Teoria da quimioafinidade. Cone de crescimento: estrutura e função. Colatralização como estratégia de direcionamento - Fasciculação seletiva no direcionamento. Colapso do cone de crescimento e fatores repulsivos. Fatores solúveis no direcionamento axonal. Fatores locais no direcionamento axonal. Receptores de membrana e sinalização intracelular (AMPc, cálcio, GMPc, fosfatases e quinases, etc) regulando direcionamento axonal. Integração de sinais moleculares pelo cone de crescimento. Arborização axonal.

BFB 892 - FUNDAMENTOS EM GLICOBIOLOGIA

Professores Responsáveis: José Osvaldo Previato, Lucia Mendonça Previato
Colaboradores:
Carga Horária: 90

Ementa: Noções sobre a glicobiologia estrutural e funcional, abrangendo os seguintes temas: Introdução: carboidratos complexos (nomenclatura, estrutura e metabolismo); 2) Glicoproteínas: isolamento e caracterização; ligação carboidrato-proteína; biossíntese; 3) Glicolipídeos: classificação, isolamento e caracterização, biossíntese; 4) Glicomoléculas contendo ácido siálico: estrutura e função; 5) Carboidratos como determinantes de especificidade biológica; 6) Uma semana de aulas práticas.